[Reddes.bvs-tech] Ayuda sobre indexación de la base artigo de scielo en la IAHx con cisis 64 bits

Thu Dec 15 15:59:46 BRST 2011

Estimado Victor, 

La versión que se presenta és, sin duda, para 64bits (identificandosela por el 64b al final de la segunda línea del banner) 

victor-64bit:/srv/iahx/iahx-server-1.3.1/bin/scielo# ./mx what 
CISIS Interface v5.7a/G/PC/W/M/32767/16/60/I - Utility MX 
CISIS Interface v5.7a/.iy0/Z/GIZ/DEC/ISI/UTL/INVX/B7/FAT/CIP/CGI/MX/W/ 64b 
Copyright (c)BIREME/PAHO 2010. [ http://www.bireme.br/products/cisis ] 
Copyright (c)BIREME/PAHO 2010. [ http://bvsmodelo.bvsalud.org/php/level.php?lang=pt&component=28&item=1 ] 

Pero no és la versión normal de uso en SciELO, que debe ser Lind y no sólo 1660, con el siguiente banner por lo tanto: 

CISIS Interface v5.7a/G/PC/W/ L /M/32767/16/60/I - Utility MX 
CISIS Interface v5.7a/.iy0/Z/GIZ/DEC/ISI/UTL/INVX/B7/FAT/CIP/CGI/MX/W/64b 
Copyright (c)BIREME/PAHO 2010. [http://www.bireme.br/products/cisis] 
Copyright (c)BIREME/PAHO 2010. [http://bvsmodelo.bvsalud.org/php/level.php?lang=pt&component=28&item=1] 

Tenga en cuenta la falta de la 'L' entre la 'W' y la 'M' en la premera línea 

Ese cambio de versiones si podría llevar a un error, y sólo en el uso del archivo invertido, pues el archivo mestre de 1660 y de Lind son idénticos. 

Francisco José Lopes 
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Enviadas: Quarta-feira, 14 de Dezembro de 2011 17:33:07 
Assunto: Re: Ayuda sobre indexación de la base artigo de scielo en la IAHx con cisis 64 bits 

Estimado Francisco, muchas gracias por su rápida respuesta. 

Yo estoy utilizando el cisis para 64-bit que descarge en http://reddes.bvsalud.org/projects/cisis/browser/trunk/test64bits/cisis-5.7a-1660-64bits.tar.gz , esta ya esta compilada para 64-bit ?. 

Le pedi la ubicación del fichero fst para general los archivos invertidos porque me imagine que esa podia ser la fuente del problema. Ya antes habia probado crear ficheros ISO, ficheros maestros y el mx me funciona bien. 

Pero si dices que no existe diferencia en archivos maestro e invertido para las plataformas de 32 y 64 bit entonces el comando ( ./mx artigo iso=artigo.iso "tp=h" "proc=@AddV91.prc" -all now ) debe ejecutarse correctamente ya que estoy utilizando los mismos ficheros ISIS, a no ser que sea un bug del MX. 

Me falto un detalle (esto en el SO de 64-bit) cuando le quito el parametro "tp=h" ( ./mx artigo iso=artigo.iso "proc=@AddV91.prc" -all now ) el comando se ejecuta sin problema y me crea el .iso. 

Aunque no lo pidio le envio los detalles de la versión CISIS y el SO: 

victor-64bit:/srv/iahx/iahx-server-1.3.1/bin/scielo# ./mx what 
victor-64bit:/srv/iahx/iahx-server-1.3.1/bin/scielo# CISIS Interface v5.7a/G/PC/W/M/32767/16/60/I - Utility MX 
victor-64bit:/srv/iahx/iahx-server-1.3.1/bin/scielo# CISIS Interface v5.7a/.iy0/Z/GIZ/DEC/ISI/UTL/INVX/B7/FAT/CIP/CGI/MX/W/64b 
victor-64bit:/srv/iahx/iahx-server-1.3.1/bin/scielo# Copyright (c)BIREME/PAHO 2010. [http://www.bireme.br/products/cisis] 
victor-64bit:/srv/iahx/iahx-server-1.3.1/bin/scielo# Copyright (c)BIREME/PAHO 2010. [http://bvsmodelo.bvsalud.org/php/level.php?lang=pt&component=28&item=1] 

victor-64bit:/srv/iahx/iahx-server-1.3.1/bin/scielo# uname -a 
Linux e3b03 2.6.32-5-amd64 #1 SMP Tue Jun 14 09:42:28 UTC 2011 x86_64 GNU/Linux 

victor-64bit:/srv/iahx/iahx-server-1.3.1/bin/scielo# cat /etc/issue 
Debian GNU/Linux 6.0 \n \l 

Hay que instalar algunas librerias adicionales ?, favor si puedes guiarnos (disculpe nuestro falta de conocimiento al respecto). Favor si puede ayudarnos se lo voy agradecer. 

Saludos 
Victor 

----- Original Message ----- 
From: Francisco J D M Lopes Santos 
To: Victor Ricardo Díaz 
Cc: Marcos Luis Mori ; Fabio Batalha C. Santos ; spinaker at adinet.com.uy ; reddes bvs-tech 
Sent: Wednesday, December 14, 2011 12:11 PM 
Subject: Re: Ayuda sobre indexación de la base artigo de scielo en la IAHx con cisis 64 bits 

Estimado Victor, 

En el caso de un sistema operativo de 64 bits, para que el CISIS compilada en 32 bits se ejecute correctamente algunas "libray" deben estar instaladas y esto explica el fracaso , ya que no hay diferencia en archivos maestro e invertido para las plataformas de 32 y 64 bits. 
En la situación el ideal es utilizar un CISIS compilada en 64 bits. 

Además, la FST que se busca está en el directorio proc/ fst de SciELO (en relación a bases / artigo sería el camino ../.. /proc/ fst / Artigo.fst ). 

Por favor, no te olvides que para conocermos la version de CISIS hacer el comando: ./mx what, y punga la salida en el e-mail (de las duas plataformas). Puedes tambien hacer "uname -a" y "cat /etc/issue" para completar la informacion del sistema operativo (no en este caso) 

Un abrazo y buena suerte 
Francisco José Lopes 
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De: "Victor Ricardo Díaz" <victorr at infomed.sld.cu> 
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Cc: "Marcos Luis Mori" <marcos.mori at bireme.org>, "Francisco José De Marco Lopes dos Santos" <francisco.lopes at bireme.org>, "Fabio Batalha C. Santos" <fabio.batalha at scielo.org>, spinaker at adinet.com.uy 
Enviadas: Quarta-feira, 14 de Dezembro de 2011 13:53:47 
Assunto: Ayuda sobre indexación de la base artigo de scielo en la IAHx con cisis 64 bits 

Error al ejecutar el comando ./mx artigo iso=artigo.iso "tp=h" 
"proc=@AddV91.prc" -all now con CISIS 64-bit, con CISIS a 32-bit no tengo 
este problema. 

A continuación reproduzco la estructura de directorio y ficheros que se 
utilizan en 32 bit: 

victor-32bit:/srv/iahx/iahx-server-1.3.1/bin/scielo# ls -la 
total 2140420 
drwxr-xr-x 3 victorr victorr 4096 2011-10-26 14:06 . 
drwxr-xr-x 3 root root 4096 2011-10-26 13:56 .. 
-rwxrwxrwx 1 victorr victorr 117 2011-10-26 13:57 AddV91.prc 
-rw-r--r-- 1 scielo scielo 56 2011-11-15 16:19 artigo.cnt 
-rw-r--r-- 1 scielo scielo 79385600 2011-11-15 16:19 artigo.ifp 
-rw-r--r-- 1 root root 52787054 2011-12-14 10:24 artigo.iso 
-rw-r--r-- 1 scielo scielo 29589504 2011-11-15 16:19 artigo.iyp 
-rw-r--r-- 1 scielo scielo 424 2011-11-15 16:19 artigo.l01 
-rw-r--r-- 1 scielo scielo 42101044 2011-11-15 16:19 artigo.l02 
-rw-r--r-- 1 scielo scielo 65416 2011-11-15 16:19 artigo.ly1 
-rw-r--r-- 1 scielo scielo 299367264 2011-11-15 16:19 artigo.ly2 
-rw-r--r-- 1 scielo scielo 1547188736 2011-11-15 16:19 artigo.mst 
-rw-r--r-- 1 scielo scielo 5616 2011-11-15 16:19 artigo.n01 
-rw-r--r-- 1 scielo scielo 29287656 2011-11-15 16:19 artigo.n02 
-rw-r--r-- 1 root root 46326272 2011-12-14 09:56 artigos.mst 
-rw-r--r-- 1 root root 50796113 2011-12-14 09:56 artigos.xml 
-rw-r--r-- 1 root root 66560 2011-12-14 09:56 artigos.xrf 
-rw-r--r-- 1 scielo scielo 12094464 2011-11-15 16:19 artigo.xrf 
-rwxrwxrwx 1 victorr victorr 180 2011-10-26 14:03 doctype.pft 
-rwxrwxrwx 1 victorr victorr 1782 2011-10-26 14:03 docweight.pft 
-rwxrwxrwx 1 victorr victorr 659 2011-10-26 14:03 gtdoc_en.id 
-rwxrwxrwx 1 victorr victorr 601 2011-10-26 14:03 gtdoc_es.id 
-rw-r--r-- 1 victorr victorr 1024 2011-10-26 14:03 gtdoc_es.mst 
-rw-r--r-- 1 victorr victorr 512 2011-10-26 14:03 gtdoc_es.xrf 
-rwxrwxrwx 1 victorr victorr 458 2011-10-26 14:03 gtdocext.id 
-rw-r--r-- 1 victorr victorr 1024 2011-10-26 14:03 gtdocext.mst 
-rw-r--r-- 1 victorr victorr 512 2011-10-26 14:03 gtdocext.xrf 
-rwxrwxrwx 1 victorr victorr 645 2011-10-26 14:03 gtdoc_pt.id 
-rw-r--r-- 1 victorr victorr 1024 2011-10-26 14:03 gtdoc_pt.mst 
-rw-r--r-- 1 victorr victorr 512 2011-10-26 14:03 gtdoc_pt.xrf 
drwxr-xr-x 3 victorr victorr 4096 2011-10-26 14:06 iso 
-rwxr-xr-x 1 victorr victorr 397704 2011-10-26 14:03 mx 
-rwxr-xr-x 1 victorr victorr 278 2011-10-26 14:03 scielo.sh 
-rw-r--r-- 1 victorr victorr 8519 2011-10-26 14:03 scielo_XML.pft 
victor-32bit:/srv/iahx/iahx-server-1.3.1/bin/scielo# ./mx artigo 
iso=artigo.iso "tp=h" "proc=@AddV91.prc" -all now 
16412 TP=H 
16412 Set #000000001 
Hits=16412 
e2b10:/srv/iahx/iahx-server-1.3.1/bin/scielo# 

Como ven el comando se ejecuta correctamente. 

Con la misma estructura anterior de directorios y archivos en un linux 
debian de 64-bit cuando ejecuto el comando: 

./mx artigo iso=artigo.iso "tp=h" "proc=@AddV91.prc" -all now 

sale el sgte error: 

fatal: leafread/read 

Pregunta: Tendre que invertir la base artigo nuevamente ?, lo que no 
encuentro el ficheto .fst para hacerlo. Que podria ser, o es un error del mx 
en 64-bit ? 

Agradeceria mucho la ayuda, gracias 
Victor 

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