[Reddes.bvs-tech] Ayuda sobre indexación de la base artigo de scielo en la IAHx con cisis 64 bits

Victor Ricardo Díaz victorr at infomed.sld.cu
Thu Dec 15 17:43:44 BRST 2011


Muchas gracias por su inestimable ayuda Francisco, todo se ejecuto OK siguiendo sus indicaciones.

saludos
victor
  ----- Original Message ----- 
  From: Francisco J D M Lopes Santos 
  To: Victor Ricardo Díaz 
  Cc: reddes bvs-tech 
  Sent: Thursday, December 15, 2011 11:59 AM
  Subject: Re: Ayuda sobre indexación de la base artigo de scielo en la IAHx con cisis 64 bits


  Estimado Victor,

  La versión que se presenta és, sin duda, para 64bits (identificandosela por el 64b al final de la segunda línea del banner)

  victor-64bit:/srv/iahx/iahx-server-1.3.1/bin/scielo# ./mx what
  CISIS Interface v5.7a/G/PC/W/M/32767/16/60/I - Utility MX
  CISIS Interface v5.7a/.iy0/Z/GIZ/DEC/ISI/UTL/INVX/B7/FAT/CIP/CGI/MX/W/64b
  Copyright (c)BIREME/PAHO 2010. [http://www.bireme.br/products/cisis]
  Copyright (c)BIREME/PAHO 2010. [http://bvsmodelo.bvsalud.org/php/level.php?lang=pt&component=28&item=1]

  Pero no és la versión normal de uso en SciELO, que debe ser Lind y no sólo 1660, con el siguiente banner por lo tanto:

  CISIS Interface v5.7a/G/PC/W/L/M/32767/16/60/I - Utility MX
  CISIS Interface v5.7a/.iy0/Z/GIZ/DEC/ISI/UTL/INVX/B7/FAT/CIP/CGI/MX/W/64b
  Copyright (c)BIREME/PAHO 2010. [http://www.bireme.br/products/cisis]
  Copyright (c)BIREME/PAHO 2010. [http://bvsmodelo.bvsalud.org/php/level.php?lang=pt&component=28&item=1]

  Tenga en cuenta la falta de la 'L' entre la 'W' y la 'M' en la premera línea

  Ese cambio de versiones si podría llevar a un error, y sólo en el uso del archivo invertido, pues el archivo mestre de 1660 y de Lind son idénticos.

  Francisco José Lopes
  ---
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  Para: "Francisco J D M Lopes Santos" <francisco.lopes at bireme.org>
  Cc: "reddes bvs-tech" <reddes.bvs-tech at listas.bireme.br>
  Enviadas: Quarta-feira, 14 de Dezembro de 2011 17:33:07
  Assunto: Re: Ayuda sobre indexación de la base artigo de scielo en la IAHx con cisis 64 bits


  Estimado Francisco, muchas gracias por su rápida respuesta.

  Yo estoy utilizando el cisis para 64-bit que descarge en http://reddes.bvsalud.org/projects/cisis/browser/trunk/test64bits/cisis-5.7a-1660-64bits.tar.gz, esta ya esta compilada para 64-bit ?. 

  Le pedi la ubicación del fichero fst para general los archivos invertidos porque me imagine que esa podia ser la fuente del problema. Ya antes habia probado crear ficheros ISO, ficheros maestros y el mx me funciona bien.

  Pero si dices que no existe diferencia en archivos maestro e invertido para las plataformas de 32 y 64 bit entonces el comando (./mx artigo iso=artigo.iso "tp=h" "proc=@AddV91.prc" -all now) debe ejecutarse correctamente ya que estoy utilizando los mismos ficheros ISIS, a no ser que sea un bug del MX.

  Me falto un detalle (esto en el SO de 64-bit) cuando le quito el parametro "tp=h" (./mx artigo iso=artigo.iso "proc=@AddV91.prc" -all now) el comando se ejecuta sin problema y me crea el .iso.

  Aunque no lo pidio le envio los detalles de la versión CISIS y el SO:

  victor-64bit:/srv/iahx/iahx-server-1.3.1/bin/scielo# ./mx what
  victor-64bit:/srv/iahx/iahx-server-1.3.1/bin/scielo# CISIS Interface v5.7a/G/PC/W/M/32767/16/60/I - Utility MX
  victor-64bit:/srv/iahx/iahx-server-1.3.1/bin/scielo# CISIS Interface v5.7a/.iy0/Z/GIZ/DEC/ISI/UTL/INVX/B7/FAT/CIP/CGI/MX/W/64b
  victor-64bit:/srv/iahx/iahx-server-1.3.1/bin/scielo# Copyright (c)BIREME/PAHO 2010. [http://www.bireme.br/products/cisis]
  victor-64bit:/srv/iahx/iahx-server-1.3.1/bin/scielo# Copyright (c)BIREME/PAHO 2010. [http://bvsmodelo.bvsalud.org/php/level.php?lang=pt&component=28&item=1]

  victor-64bit:/srv/iahx/iahx-server-1.3.1/bin/scielo# uname -a
  Linux e3b03 2.6.32-5-amd64 #1 SMP Tue Jun 14 09:42:28 UTC 2011 x86_64 GNU/Linux

  victor-64bit:/srv/iahx/iahx-server-1.3.1/bin/scielo# cat /etc/issue
  Debian GNU/Linux 6.0 \n \l

  Hay que instalar algunas librerias adicionales ?, favor si puedes guiarnos (disculpe nuestro falta de conocimiento al respecto). Favor si puede ayudarnos se lo voy agradecer.

  Saludos
  Victor
    ----- Original Message ----- 
    From: Francisco J D M Lopes Santos 
    To: Victor Ricardo Díaz 
    Cc: Marcos Luis Mori ; Fabio Batalha C. Santos ; spinaker at adinet.com.uy ; reddes bvs-tech 
    Sent: Wednesday, December 14, 2011 12:11 PM
    Subject: Re: Ayuda sobre indexación de la base artigo de scielo en la IAHx con cisis 64 bits


    Estimado Victor,

    En el caso de un sistema operativo de 64 bits, para que el CISIS compilada en 32 bits se ejecute correctamente algunas "libray" deben estar instaladas y esto explica el fracaso, ya que no hay diferencia en archivos maestro e invertido para las plataformas de 32 y 64 bits.
    En la situación el ideal es utilizar un CISIS compilada en 64 bits.

    Además, la FST que se busca está en el directorio proc/fst de SciELO (en relación a bases/artigo sería el camino ../../proc/fst/Artigo.fst).

    Por favor, no te olvides que para conocermos la version de CISIS hacer el comando: ./mx what, y punga la salida en el e-mail (de las duas plataformas). Puedes tambien hacer "uname -a" y "cat /etc/issue" para completar la informacion del sistema operativo (no en este caso)

    Un abrazo y buena suerte
    Francisco José Lopes
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    De: "Victor Ricardo Díaz" <victorr at infomed.sld.cu>
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    Cc: "Marcos Luis Mori" <marcos.mori at bireme.org>, "Francisco José De Marco Lopes dos Santos" <francisco.lopes at bireme.org>, "Fabio Batalha C. Santos" <fabio.batalha at scielo.org>, spinaker at adinet.com.uy
    Enviadas: Quarta-feira, 14 de Dezembro de 2011 13:53:47
    Assunto: Ayuda sobre indexación de la base artigo de scielo en la IAHx con cisis 64 bits

    Error al ejecutar el comando ./mx artigo iso=artigo.iso "tp=h" 
    "proc=@AddV91.prc" -all now con CISIS 64-bit, con CISIS a 32-bit no tengo 
    este problema.

    A continuación reproduzco la estructura de directorio y ficheros que se 
    utilizan en 32 bit:

    victor-32bit:/srv/iahx/iahx-server-1.3.1/bin/scielo# ls -la
    total 2140420
    drwxr-xr-x 3 victorr victorr       4096 2011-10-26 14:06 .
    drwxr-xr-x 3 root    root          4096 2011-10-26 13:56 ..
    -rwxrwxrwx 1 victorr victorr        117 2011-10-26 13:57 AddV91.prc
    -rw-r--r-- 1 scielo  scielo                56 2011-11-15 16:19 artigo.cnt
    -rw-r--r-- 1 scielo  scielo    79385600 2011-11-15 16:19 artigo.ifp
    -rw-r--r-- 1 root    root      52787054 2011-12-14 10:24 artigo.iso
    -rw-r--r-- 1 scielo  scielo    29589504 2011-11-15 16:19 artigo.iyp
    -rw-r--r-- 1 scielo  scielo         424 2011-11-15 16:19 artigo.l01
    -rw-r--r-- 1 scielo  scielo    42101044 2011-11-15 16:19 artigo.l02
    -rw-r--r-- 1 scielo  scielo       65416 2011-11-15 16:19 artigo.ly1
    -rw-r--r-- 1 scielo  scielo   299367264 2011-11-15 16:19 artigo.ly2
    -rw-r--r-- 1 scielo  scielo  1547188736 2011-11-15 16:19 artigo.mst
    -rw-r--r-- 1 scielo  scielo        5616 2011-11-15 16:19 artigo.n01
    -rw-r--r-- 1 scielo  scielo    29287656 2011-11-15 16:19 artigo.n02
    -rw-r--r-- 1 root    root      46326272 2011-12-14 09:56 artigos.mst
    -rw-r--r-- 1 root    root      50796113 2011-12-14 09:56 artigos.xml
    -rw-r--r-- 1 root    root         66560 2011-12-14 09:56 artigos.xrf
    -rw-r--r-- 1 scielo  scielo    12094464 2011-11-15 16:19 artigo.xrf
    -rwxrwxrwx 1 victorr victorr        180 2011-10-26 14:03 doctype.pft
    -rwxrwxrwx 1 victorr victorr       1782 2011-10-26 14:03 docweight.pft
    -rwxrwxrwx 1 victorr victorr        659 2011-10-26 14:03 gtdoc_en.id
    -rwxrwxrwx 1 victorr victorr        601 2011-10-26 14:03 gtdoc_es.id
    -rw-r--r-- 1 victorr victorr       1024 2011-10-26 14:03 gtdoc_es.mst
    -rw-r--r-- 1 victorr victorr        512 2011-10-26 14:03 gtdoc_es.xrf
    -rwxrwxrwx 1 victorr victorr        458 2011-10-26 14:03 gtdocext.id
    -rw-r--r-- 1 victorr victorr       1024 2011-10-26 14:03 gtdocext.mst
    -rw-r--r-- 1 victorr victorr        512 2011-10-26 14:03 gtdocext.xrf
    -rwxrwxrwx 1 victorr victorr        645 2011-10-26 14:03 gtdoc_pt.id
    -rw-r--r-- 1 victorr victorr       1024 2011-10-26 14:03 gtdoc_pt.mst
    -rw-r--r-- 1 victorr victorr        512 2011-10-26 14:03 gtdoc_pt.xrf
    drwxr-xr-x 3 victorr victorr       4096 2011-10-26 14:06 iso
    -rwxr-xr-x 1 victorr victorr     397704 2011-10-26 14:03 mx
    -rwxr-xr-x 1 victorr victorr        278 2011-10-26 14:03 scielo.sh
    -rw-r--r-- 1 victorr victorr       8519 2011-10-26 14:03 scielo_XML.pft
    victor-32bit:/srv/iahx/iahx-server-1.3.1/bin/scielo# ./mx artigo 
    iso=artigo.iso "tp=h" "proc=@AddV91.prc" -all now
      16412  TP=H
      16412  Set #000000001
      Hits=16412
    e2b10:/srv/iahx/iahx-server-1.3.1/bin/scielo#

    Como ven el comando se ejecuta correctamente.

    Con la misma estructura anterior de directorios y archivos en un linux 
    debian de 64-bit cuando ejecuto el comando:

    ./mx artigo iso=artigo.iso "tp=h" "proc=@AddV91.prc" -all now

    sale el sgte error:

    fatal: leafread/read

    Pregunta: Tendre que invertir la base artigo nuevamente ?, lo que no 
    encuentro el ficheto .fst para hacerlo. Que podria ser, o es un error del mx 
    en 64-bit ?

    Agradeceria mucho la ayuda, gracias
    Victor 


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